ConvexGating aprende de forma automática e interpretable las estrategias de separación celular en citometría de flujo mediante inteligencia artificial. El método se validó experimentalmente en subtipos de CD8+ y células progenitoras del tejido adiposo, y también pudo transferirse a datos de Cytometry by Time of Flight y Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing.
Por qué es importante
La importancia del estudio no radica únicamente en automatizar el proceso de gating sobre los criterios con los que se separarán las células en citometría de flujo, sino también en hacerlo interpretable. Esta característica permite evaluar cómo se crearon las estrategias obtenidas en distintas muestras, especialmente en subtipos de CD8+ y células progenitoras del tejido adiposo. La validación experimental del método muestra que el enfoque no se limita al nivel computacional, mientras que su transferencia a distintos tipos de datos unicelulares demuestra que su ámbito de uso no está restringido a una única plataforma de medición. No obstante, su capacidad de adaptación a distintos tipos de datos deja abierta la cuestión de si en todas las plataformas se obtienen los mismos resultados y el mismo grado de facilidad de interpretación.